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공동활용 연구장비

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실시간 중합효소 연쇄반응기

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Real-time polymerase chain reactor

  • 모델명 QuantStudio 3
  • 제조사 Applied Biosystems
  • 장비용도 시험
  • 장비구분 화합물전처리/분석장비 > 바이오제조/분석장비 > 유전자증폭장치

상세정보

구축일자 2016-09-23
납품업체 Applied Biosystems
위치 광주광역시 북구 용봉로 77 (용봉동) (용봉동) 전남대학교 용봉캠퍼스 치의학전문대학원 2호관 F3 302호
구성및성능 ① 실시간유전자 분석시스템 1) 화학물질 (1) Fluorogenic 5' Nuclease Assay 방식
PCR 반응용액에 표적 염기서열과 상보성이 있는 형광염료가 붙은 탐침을 첨가하는 방식이며, 탐침은 표식과 흡수염료를 포함하고 있는 20bp 내외의 짧은 뉴클레오티드 집합체로서, PCR 과정에서 시료 DNA의 특정 표적염기서열이 존재할 경우 순방향과 역방향 프라이머 사이에 특이하게 탐침이 결합된다. 이후 합성효소의 핵산분해 활성이 탐침을 잘라내면 그 결과로 탐침에 붙어 있던 표식 염료의 광도가 증가 하게 되며, 이 과정은 매 cycle에서 일어나며 PCR 산물의 축적을 방해하지 않는다.
(2) Minor Groove Binder Assay Minor Groove Binder 는 탐침의 녹는 온도(Tm)를 향상시켜 더 짧은 길이의 탐침으로도 실험할 수 있게 되며, 짧은 probe는 향상된 식별력을 제공한다. 이 탐침은 A/T가 많이 존재하는 염기서열에 대한 개체별 차이도 효과적으로 검증하도록 한다.
(3) Double-stranded DNA Binding Dye SYBR Green I
두 가닥의 DNA에 효과적으로 결합하는 SYBR Green I dye는 PCR 산물의 축적을 매우 쉽게 관찰 할 수 있게 하며, PCR 반응 중 DNA의 양이 기하급수적으로 증가함에 따라 염료로부터 방출되는 형광의 양도 비율적으로 증가한다. 2) 온도조절파트 (1) 블록 구성 : 0.1ml 96well, 0.2ml 96well (2) 반응 용액의 볼륨 : 10-30ul(0.1ml), 10-100ul(0.2ml) (3) 최대 온도조절 속도 : 초당 6.5도 (4) 온도의 균등성 : 0.4℃ (5) 온도의 정확도 : 0.25℃ (6) VeriFlex 블록 : 3 개의 독립적인 온도구획 (7) 가열/냉각 방법 : Peltier (8) 운영시간 : 30분 이내 3) 형광 감지 시스템 (1) 발광 광원 : Bright white LED (2) 필터/색 : 4 coupled filters (3) 발광/검출범위 : 450-600n
장비안내 1) 본 장비는 0.2ml standard 96well, 빠른 0.1ml 96well 모델의 두가지 타입의 블록을 가진 모델 중에 선택이 가능하며, 모든 블록은 30분 이내에 빠른 프로토콜의 운영이 가능하다.
2) 96well 샘플 블록은 최소 3개 이상으로 분리된 펠타이어 블록으로 구성되어 있으며, 블록 사이의 최대 온도 편차는 25°C이고, 이웃한 블록에서 온도의 최대 편차는 5°C까지 허용가능하다.
3) 0.1ml 96-well 블록모델에서는 10μl 에서 30μl 의 반응볼륨을 지원하고, 0.2ml 96-well 블록모델에서는 10μl 에서 100μl의 반응액을 사용하도록 디자인되어 있다.
4) 장비는 제작시에 FAM™, SYBR® Green I, VIC®, NED, ABY, JUN, TAMRA, and ROX™ 염료에 맞춰 교정 완료하여 제공하였다.
5) 장비에서 녹는곡선 또는 해리는 0.015°C ≤ ΔT ≤ 3.66°C 사이의 다양한 단계에서 일어난다.

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