비상상황 발생 시 마이크로그리드 자율 운전 시스템 및 방법이 제공된다. 마이크로그리드의 비상상황 시 자율 운전 방법은 마이크로그리드로부터 마이크로그리드에 포함된 복수의 경로에 대한 알람 데이터를 수신하는 단계; 알람 데이터를 통해 각각의 경로에 대한 비상상황을 가식별하는 단계; 퍼지 알고리즘을 이용하여 상기 가식별된 비상상황에 대해 최종 확정하는 단계; 최종 확정된 비상상황이 복합적으로 발생한 경우, 비상상황의 중요도에 따라 우선순위를 부여하는 단계; 및 상기 우선순위를 기반으로 상기 최종 확정된 비상상황의 종류에 따라 마이크로그리드를 자율 제어하는 단계;를 포함한다.