본 발명은 최대 효율점 추적(MEPT: maximum efficiency point tracking)을 이용한 전력 변환 시스템 및 그의 제어 방법에 관한 것이다. 전력 변환의 제어 방법은, 제1 전력 변환장치 및 제1 전력 변환장치와 병렬로 연결된 제2 전력 변환장치를 포함하는 전력 변환 시스템의 제어 방법으로서, 전력 변환 시스템의 제1 효율을 결정하는 단계, 제1 전력 변환 장치에 입력되는 제1 전류의 양을 증가시키고 제2 전력 변환 장치에 입력되는 제2 전류의 양을 감소시키는 제1 모드 및 제1 전력 변환 장치에 입력되는 제1 전류의 양을 감소시키고 제2 전력 변환 장치에 입력되는 제2 전류의 양을 증가시키는 제2 모드 중 한 모드로 제1 전류의 양과 제2 전류의 양을 변경하고, 전력 변환 시스템의 제2 효율을 결정하는 단계, 제1 효율과 제2 효율을 비교하고, 비교 결과에 따라 전류 조절 모드를 제1 모드 또는 제2 모드로 결정하는 단계, 및 결정된 전류 조절 모드에 따라 제1 전류의 양과 제2 전류의 양을 변경하는 단계;를 포함한다.