본 발명은 고안정성 섬유아세포 성장인자-9 변이체 및 이의 용도에 관한 것으로, 더욱 상세하게는, 서열번호 1의 아미노산 서열 1개 이상의 아미노산이 시스테인으로 치환되고, 표면의 아미노산 1개가 다른 아미노산으로 치환된 고안정성 섬유아세포 성장인자-9(fibroblast growth factor-9, FGF-9) 변이체(mutant), 상기 FGF-9 변이체를 코딩하는 DNA 염기 서열, 상기 DNA 염기 서열을 포함하는 발현벡터, 상기 발현벡터에 의해 형질전환된 형질전환체, 상기 FGF-9 변이체 생산 방법, 및 FGF-9 변이체를 유효성분으로 포함하는 조성물에 관한 것이다. 본 발명에 의하면, 본 발명의 FGF-9 변이체는 열 안정성과 수용액 상태에서의 안정성이 우수하여 유통과 보관 과정 중에서도 기존의 천연형 FGF-9 제품과 다르게 활성을 잃지 않는 기능성 화장품, 피부 염증 치료제, 창상 피복제 및 발모, 육모, 탈모치료제 등의 생산이 가능하다.