본 발명은 분지쇄 아미노산(Branched chain amino acid; BCAA) 생성능이 뛰어난 바실러스 아밀로리퀴파시엔스(Bacillus amyloliquefaciens) NY-PSH 124-1 균주에 관한 것으로서, 갈색거저리, 유청단백질(whey protein isolate; WPI) 또는 콩단백질(Isolate soy protein; ISP)을 기질로 이용하는 경우 상기 균주의 분지쇄 아미노산의 생성능이 월등히 우수하므로, 이를 효과적으로 분지쇄 아미노산이 강화된 고급 단백질원으로서 노령인구 또는 유아를 대상으로 한 필수적인 단백질 보충원 또는 건강기능식품의 생산에 이용할 수 있다.