본 발명은 천연재료인 쪽식물에 포함되어 있는 인디칸 혹은 그 유도체에 작용하여 염료와 의약품 원료로 이용되는 인디고 블루와 인디루비딘 제조에 유용한 핵심 효소인 β-글리코시다아제(β-glucosidase)를 코딩하는 유전자를 포함하는 형질전환 미생물 및 그를 이용한 인디고 염료의 생산 방법에 관한 것이다. 본 발명에 의하면 쪽 식물을 이용한 천연 염료의 생산, 화장품이나 물감 등 다양한 분야에서 활용할 수 있을 것으로 기대된다. 또한 제조공정이 친환경적이고 천연재료를 이용함으로 면역, 항균작용과 관련한 의약품의 개발에도 유리할 것으로 판단된다. 부수적으로 단일 효소공정이 지니는 장점으로 인해 전통적인 인디고 염료의 단점, 즉 고비용, 재현성 및 균일화 측면에서의 문제점도 극복할 수 있을 것으로 기대되어지며, 기존의 인돌 혹은 트립토판을 이용한 복잡한 생산과정을 대체할 수 있을 것이다. 글루코시다아제, 인디칸, 인디고