본 발명은 엉겅퀴 추출물, 이의 분획물 또는 이로부터 분리한 화합물을 유효성분으로 함유하는 어류용 항바이러스 조성물에 관한 것이다. 본 발명에 따른 엉겅퀴 추출물, 이의 분획물 또는 이로부터 분리한 화합물을 유효성분으로 함유하는 어류용 항바이러스 조성물은 폐사율에 영향을 주는 바이러스에 대하여 항바이러스 효과가 있고, 상기 조성물을 복강주사하거나 경구투여하거나 수조투여함으로써 양식어류의 폐사율에 큰 영향을 미치는 바이러스에 의한 질환의 예방 또는 치료가 가능할 뿐만 아니라, 이에 의해 어류 양식산업의 원가절감과 부가가치 증대에 크게 기여할 수 있다.