본 발명은 전복 동결정자의 염색체 손상 여부 판단 방법에 관한 것으로서, 단세포 전기영동법(Single Cell Gel Electrophoresis Assay(SCGE Assay))을 수행하여 전복 동결 정자의 염색체 손상 유무를 평가함으로써 대량생산을 위한 효율적인 평가 방법을 제공하므로, 이를 효과적으로 패류 정자은행 구축에 필요한 구체적 자료를 제공할 뿐만 아니라 전복 및 타 패류의 대량생산을 위한 기술개발에 실질적 정보를 제공할 수 있다.