본 발명은 바실러스 아밀로리쿼파시엔스 EML-CAP-03(Bacillus amyloliquefaciens)으로부터 유래된 신규한 항진균 펩타이드 BA-1 및 이의 용도에 관한 것으로, 구체적으로 본 발명의 바실러스 아밀로리쿼파시엔스 EML-CAP-03(Bacillus amyloliquefaciens)으로부터 분리한 서열번호 1로 기재되는 아미노산 서열을 가지는 신규한 펩타이드는 푸사리움 솔라니(Fusarium solani) 또는 푸사리움 옥시스포룸(Fusarium oxysporum) 곰팡이에 대하여 현저한 항진균 효과를 나타내고, 세포독성이 없는 것을 확인함으로써, 항진균용 약학적 조성물, 화장료 조성물, 농약, 건강식품, 방부용 조성물 및 의약외품으로 유용하게 사용될 수 있다.