본 발명은 노균병(Downy mildew) 저항성 양파(Allium cepa) 선별용 마커, 상기 마커에 대한 프라이머 세트, 상기 프라이머 세트를 이용한 노균병 저항성 양파 선별 방법 및 노균병 저항성 양파 선별용 키트를 제공한다. 본 발명에 따르면, 본 발명은 노균병 저항성 양파를 선별하기 위한 간단하고 명확한 프라이머를 제공한다. 이는 종래의 복잡한 공정 및 장시간이 소요되는 육종 계통 분석을 단시간에 정확하게 선별할 수 있는 PCR 또는 CAPS용 프라이머이다.