본 발명은 (a) 변이(mutation)가 있는 비-형광성 형광 단백질을 코딩하는 뉴클레오타이드 서열로 어류를 형질전환 시키는 단계; (b) 상기 형질전환된 어류에 시험물질을 처리하는 단계; 및 (c) 상기 시험물질이 처리된 어류 내 상기 도입된 뉴클레오타이드 서열에서 복귀변이(back mutation)가 발생되어 상기 비-형광성 형광 단백질이 형광성 단백질로 변이되어 발생되는 형광을 측정하는 단계를 포함하는 시험물질의 유전독성 분석방법에 관한 것이다. 본 발명에 따르면, 본 발명의 형광 단백질 변이체, 바람직하게는 야생형 EGFP 변이체가 형질전환된 제브라피쉬(Brachydanio rerio) 라인인 MutaFish 시스템은 시험물질 처리에 의해 형광 단백질 변이체의 복귀(reversion)가 유발된 형광 치어를 생산하여 시험물질의 유전독성을 측정할 수 있는 매우 우수한 동물 시스템을 제공한다. 따라서, 본 발명의 MutaFish 시스템은 종래기술(예컨대, 에임스 테스트)의 한계점이었던 진핵생물에서 시험물질의 유전독성을 매우 간단하고 신속하게 분석할 수 있다.