본 발명은 간염 A형 바이러스 또는 잉어의 봄 바이러스의 분리 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는, 다음의 단계를 포함하는 간염 A형 바이러스(Hepatitis A Virus) 또는 잉어의 봄 바이러스(Spring Viremia of Carp Virus)의 분리 방법을 제공한다: (a) 자성(magenetic)비드-결합 G 단백질을 항-간염 A형 바이러스 항체 또는 항-랍도바이러스 항체와 결합하여 바이러스 탐침자를 제조하는 단계; (b) 상기 바이러스 탐침자를 분석 시료와 접촉하여 바이러스 탐침자-바이러스 복합체를 형성하는 단계; 및 (c) 상기 바이러스 탐침자-바이러스 복합체를 분리하는 단계. 본 발명에 따르면, 본 발명은 바이러스가 혼합된 시료로부터 간염 A형 바이러스 또는 잉어의 봄 바이러스를 순수하게 분리할 수 있다.