본 발명은 나노하이브리드 소재 및 그 제조방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 양친성 분자 또는 기능성 양친성 분자의 자기조립체를 이용하여 크기 및 형태의 제어가 가능한 나노구조를 형성하고, 이를 매트릭스로 도입함으로써 크기 및 형태의 제어가 가능한 하부나노구조 및/또는 기능성 물질이 매트릭스에 포함된 구조를 갖는 나노하이브리드복합체 및 그 제조방법에 관한 것이다.