본 발명은 생검장치를 갖는 캡슐장치에 관한 것으로, 일측이 개구된 선형의 가이드 중공부(111)가 형성된 몸체부(110)와; 전단부에 채취조직을 담지할 수 있는 요홈(121a)이 형성된 팁(121)과, 상기 팁(121)과 일렬로 고정된 자성체(122)를 포함하여 상기 가이드 중공부(111) 내에 전후 이동 가능하게 삽입되어 외부 자기장과 상기 자성체와의 자기력에 의해 전후 구동이 이루어지는 생검부재(120)와; 상기 가이드 중공부(111) 내에서 상기 생검부재(120)의 위치에 따라서 상기 생검부재(120)의 요홈(121a)이 상기 몸체부(110)의 외부와 격리가 가능하도록 상기 가이드 중공부(111)의 개구부에 마련되는 세퍼레이터(130);를 포함하여, 병변으로부터 채취된 조직을 외부 오염으로부터 보호할 수 있는 효과가 있다.