본 명세서에서는 종래 기술의 한계점을 극복하여, CRISPR/Cas12f1 시스템의 세포 내 유전자 편집 활성을 높이기 위한, 엔지니어링 된 Cas12f1 가이드 RNA를 제공한다. 상기 엔지니어링 된 Cas12f1 가이드 RNA는 자연계에서 발견되는 가이드 RNA의 구조 일부를 변형한 것이다. 상기 엔지니어링 된 Cas12f1 가이드 RNA는 그 구성 중 Cas12f1 단백질과 상호작용하는 역할을 하는 스캐폴드 영역의 적어도 일부가 변형된 것을 특징으로 한다. 상기 엔지니어링 된 스캐폴드 영역은 자연계에서 발견되는 가이드 RNA의 스캐폴드 영역과는 다른 것을 특징으로 한다.