본 발명은 자일라리아 그람미카 균주로부터 분리한 그람미신 화합물을 유효성분으로 함유하는 선충 방제용 조성물 및 이의 용도에 관한 것으로, 본 발명에 따른 선충 방제용 물질인 그람미신(grammicin)은 천연물로부터 유래하여 인체에 무해하고 환경오염을 유발하지 않으면서 뿌리혹선충에 대해 우수한 방제활성을 나타내므로, 환경 친화적인 천연물 살선충제의 개발 및 고부가가치의 유기농산물 생산에 유용하게 사용할 수 있다. 또한, 동물 및 인체의 선충을 방제하는 약품 개발에 직접적으로 또는 선도물질로서 이용될 수 있다. 이러한 기술이 개발되어 국내기업에 이양되고 생물적방제 제품이 생산된다면 국내 친환경농산물 생산에 이바지할 뿐만 아니라, 세계시장에 수출되어 외화 획득에 기여할 수 있다.