본 발명은 (a) 배를 분쇄 및 건조하여 배분말을 포함하는 재료를 제조하는 단계; (b) 재료를 시스테인 함유 용액과 혼합하여 단백질 분해효소가 용출된 혼합용액을 제조하는 단계; 및 (c) 혼합용액에 주정을 첨가하여 에탄올 침전물을 수득하는 단계; 및 (d) 에탄올 침전물에 베이킹소다, 소금 및 솔비톨을 포함하는 첨가제를 첨가하여 천연 연육제를 제조하는 단계;를 포함하는 천연 연육제의 제조방법에 관한 것이다. 이에 의하여, 본 발명의 배 유래 천연 연육제는 국내에서 생산되는 배(pear) 유래의 천연효소가 주요성분으로 포함하여 인체에 유익하도록 하고, 고기에 적용 시 고기의 조직이 물러지는 현상을 일으키지 않도록 연육제로 이용시 고기의 맛과 질감을 최적화 하면서도 인체의 유해성이 없고, 항산화 활성을 보유하며 육류가공이나 요리시 생성되는 산화물과 아질산염을 제거할 수 있으며, 원료를 국내산으로 충당할 수 있어 경제적인 면에서 유리한 효과가 있다.