본 발명은 전분 또는 말토올리고당 등을 기질로 이용할 수 있는 내열성 사이클로덱스트란 생성 효소, 상기 효소의 유전자를 포함하는 재조합 벡터, 상기 재조합 벡터로 형질전환된 형질전환체, 상기 형질전환체를 이용하여 내열성 사이클로덱스트란 생성효소를 제조하는 방법, 및 상기 효소를 이용하여 사이클로덱스트란을 제조하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따르면, 전분 또는 말토올리고당과 같은 저가의 기질을 이용할 수 있을 뿐만 아니라 고온에서도 안정성이 높아 대량 생산공정에 적합한 사이클로덱스트란 생성 효소를 제공할 수 있게 된다. 또한, 이러한 사이클로덱스트란 생성 효소를 이용함으로써 경제적이고 용이하게 사이클로덱스트란을 제공할 수 있어 산업적 가치가 높다.