본 발명은 약물전달 및 자기 구동을 위한 나노복합체에 관한 것으로서, 약물을 포함하는 약물 나노입자와 자성입자를 포함하는 자성 나노입자가 이온 결합된 자기 구동에 의한 약물 표적용 나노복합체를 포함한다. 상기와 같은 본 발명에 따르면, 병을 치료할 수 있는 약물 혹은 자장에 반응하는 자성입자 등을 이용하여 제작한 나노입자들을 결합시켜 혈관 내에서 자기 제어가 가능한 사이즈의 나노복합체를 제조함으로써, 자장으로 병변주변의 미세혈관으로 나노복합체를 이동시키고 도달시 외부자극으로 각각 나노입자로 해체시켜 수백 나노미터 직경의 미세혈관 내부로 침투가 가능한 나노복합체의 구성요소 및 제조방법을 제공하는 효과가 있다.