본 발명은 마이크로 로봇을 구동하기 위한 전자기 구동 코일부에 자기 차폐부를 장착함으로써 마이크로 로봇의 구동영역 내에서 자기장 발생 세기를 증가시키거나, 두 개의 전자석 결합을 통해 국소적으로 자기장을 집속시킬 수 있는 마이크로 로봇 구동장치 및 이를 이용한 시스템에 관한 것이다. 상기와 같은 본 발명에 따르면, 관심영역 내의 자기장 발생 세기를 증가시키거나, 자기장을 집속시킴으로서 체내 주입된 마이크로 로봇의 구동을 제어할 수 있는 효과가 있다.