본 발명은 세균에 대한 선택성이 개선된 항균 펩토이드 및 이의 용도에 관한 것이다. 구체적으로, 본 발명은 높은 항균활성을 갖고 동물 세포에 대한 독성이 크게 감소된 항균 펩토이드에 관한 것이다. 본 발명의 항균 펩토이드는 나선구조의 접힘 정도 또는 전하 특성을 변화시킴으로써 세균에 대해 우수한 항균활성을 보이고 동물의 세포에는 낮은 세포독성을 나타낸다. 따라서, 본 발명의 항균 펩토이드는 세균에 대한 선택성이 개선되었으므로, 항균용 조성물로써 유용하게 사용될 수 있다.