본 발명은 공유된 전해질 내에서 직렬 연결된 미생물 연료전지 및 이의 직렬 연결 방법에 관한 것이다. 더욱 상세하게는 미생물 연료전지에 양전하 전극부를 포함시켜, 상기 미생물 연료전지의 화학 반응으로 발생하는 수소 이온에 의한 단락 현상을 억제할 수 있는 직렬 연결된 미생물 연료전지를 제공한다. 따라서 본 발명의 미생물 연료전지는 상기 단락 현상의 억제에 따라 직렬 연결 시 에너지 손실을 줄일 수 있으며, 이를 통해 에너지 생산량이 증가될 수 있는 효과가 있다.