뇌-컴퓨터 인터페이스 시스템의 신뢰도 향상을 위한 방법이 개시된다. 본 발명의 일 실시 예에 따른 뇌-컴퓨터 인터페이스 시스템의 신뢰성 향상을 위한 방법은, 제1 자가 성능 진단을 수행하는 단계, 상기 자가 성능 진단 결과를 포함하는 데이터에 기초하여 BCI 시스템의 적합여부를 판정하는 제1 예측시스템을 구성하는 단계, 상기 BCI 시스템에 적용하기 위해 사용자의 뇌파에 따른 사용자의 의도가 저장되는 분류기를 구성하는 단계, 사용자의 뇌파에 따라 BCI 시스템의 출력값을 도출하는 단계, 상기 출력값의 신뢰성을 측정하는 단계 및 상기 출력값의 사용여부를 결정하는 단계를 포함한다.