분리막의 파울링 저감 효과를 나타낼 수 있는 가압형 정삼투 모듈을 이용한 해수 담수화 시스템 및 해수 담수화 공정에 대하여 개시한다. 본 발명에 따른 해수 담수화 시스템은 순환펌프에 의해 가압된 유도용액이 제1방향으로 유입되고, 고압펌프에 의해 가압된 유입수가 제2방향으로 유입되며, 상기 유입된 유도용액이 여과하여 처리수를 생성하고, 상기 유입된 유입수를 여과하여 제1농축수을 생성하는 가압형 정삼투 모듈; 및 상기 가압형 정삼투 모듈로부터 공급받은 처리수를 여과하여 제2농축수와 담수를 생성하는 역삼투 모듈;을 포함하고, 상기 가압형 정삼투 모듈은 상기 제1농축수가 배출되는 라인에 위치하고, 개폐 조절에 의해 상기 가압형 정삼투 모듈에 유입되는 유입수에 비연속적 가압을 수행하는 압력제어 밸브를 포함하는 것을 특징으로 한다.