본 발명은 B세포 매개 면역질환인 중증근무력증을 예방, 개선 또는 치료하기 위한 미생물을 유효성분으로 포함하는 프로바이오틱에 관한 것이다. 본 발명의 조성물은 조절 수지상 세포(regulatory dedritic cell)를 생성시키고, 아세틸콜린수용체-반응성 림프구 증식을 억제하며, 혈중 항-아세틸콜린수용체 면역글로불린 G(IgG) 및/또는 염증성 사이토카인 레벨을 감소시킴으로써 B세포 매개 면역질환인 중증근무력증을 치료한다. 본 발명의 조성물은 인체에 무해한 미생물 균주를 이용하기 때문에, 안전한 의약 또는 식품을 제공할 수 있다.