본 발명은 어류양식용 산패억제 및 무균사료의 제조방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 어류양식용 생어사료 및 배합사료에 항산화제로서 부틸레이티드 하이드록시애니솔 (Butylated hydroxyanisole, BHA)을 첨가하여 사료의 산패를 억제하고 방사선을 조사하여 사료내 병원성 세균을 멸균하는 어류양식용 산패억제 및 무균사료의 제조방법에 관한 것이다. 본 발명의 제조방법은 항산화제와 방사선 조사를 단독 또는 병용처리함으로써 산패사료의 섭취 및 병원성 세균의 감염에 의한 어류의 질병발생을 효과적으로 예방할 수 있는 위생적이고 영양학적으로 안전한 어류양식용 사료의 제조에 유용하게 사용될 수 있다.