본 연구는 저렴하고 신속한 RAPD 방식을 채택하여 재현성이 높은 많은 수의 밴드수를 획득할 수 있는 프라이머를 선정하기 위하여 수행하였다. PCR 증폭에 필요한 적정 DNA 농도는 1~20ng이었으며, 35~40℃의 annealing 온도에서 밴드의 구분이 가장 확실하였다. Taq polymerase 농도는 1.0unit에서 효율이 가장 좋았다. RAPD용 프라이머 191개 중 155개 프라이머에서 밴드 증폭여부를 구분할 수 있었으며, 이 중 100개의 프라이머가 재현성이 있는 것으로 확인되었다. 재현성이 있는 프라이머는 총 밴드수 중 다형밴드 비율이 80% 이상인 것과 아가로스 젤 상에서 명확히 구분할 수 있는 밴드를 가진 프라이머 20개를 선발하였다. 본 연구를 통하여 생성된 DNA fingerprint 자료를 인터넷에 공개하여(http://hanth.jnu.ac.kr) 장미 유전연구를 통한 육종 프로그램을 직간접적으로 지원할 수 있을 것이다.