비용회수방식의 사용료산정체계를 활용하는 우리나라의 항만은 12시간 이내 접안선박에 대해 총톤10톤당 외항선 340원, 내항선 114원을 사용료로 부과하고 있다. 그러나 이러한 사용료체계는 실제 비용을 보전시키기에 미흡하며, 마케팅 전략도구의 역할도 수행할 수 없다. 이에 본 논문에서는 비용회수와 시장 지향적 가격체계를 병행하는 방식으로 협조적 게임이론의 비용배분방법을 통해 항만의 공정한 시설사용료 산정방식을 연구 한다. 현행 사용료체계가 항만의 주요 고객인 선사들의 항만에 대한 공헌도를 반영하지 않기 때문에 본 연구에서는 시장중심 가격체계에 따라 항만에의 공헌을 기준으로 선사의 사용료를 공정하게 우대해 줄 수 있는 방법을 제시한다. 개발된 모형과 산정방법은 광양항 컨테이너부두에 적용하여 실제 활용방안을 모색하고 추후 연구 과제를 검토한다.