곡성군 삼기천, 죽곡천, 목사동천에서 2020년 3월부터 2021년 2월까지 매월 4개 정점에서 족대와 투망을 이용하여 어류 군집 특성을 조사하였다. 채집된 어류는 총 4목 7과 33종, 5,940개체로, 피라미 (Zacco platypus)가 802개체로 전체 출현량의 13.5%를 차지하여 가장 우점하는 종이었다. 다음으로는 갈겨니 (Z. temminckii)가 741개체 (12.5%), 납자루 (Acheilognathus lanceolata)가 577개체 (9.7%), 각시붕어 (Rhodeus uyekii)가 557개체 (9.4%), 모래무지 (Pseudogobio esocinus)가 398개체 (6.7%)를 차지하여 우점하였다. 계층 군집분석 (HCA) 결과, 조사된 어류 군집은 BrayCurtis 유사도에 따라 세 개의 그룹으로 구분되었다. Group 1은 죽곡천의 모든 정점이 하나의 클러스터를 형성하였고, Group 2는 삼기천의 일부 정점 (SG1, SG2), Group 3은 목사동천의 모든 정점과 삼기천의 일부 정점 (SG3, SG4)으로 나타났다. 멸종위기종인 모래주사 (Microphysogobio koreensis)와 큰줄납자루 (A. majusculus)가 출현였으며 곡성군 하천의 장기적인 생태 변화를 모니터링하여 기후 변화나 비점 오염 등 다양한 환경 요인이 생물 군집과 생태계 안정성에 미치는 영향과 이를 바탕으로 효과적인 보전 전략을 수립하여 고유종의 서식지 및 생태계를 안정적으로 관리함으로써 곡성군 하천의 생태적 안정성을 유지하고 종 다양성 보전에 기여할 수 있을 것으로 생각 된다