본 연구는 공공부문의 내부통제 운영현황에 대해 분석한다. 신외감법 도입으로 인하여 민간기업의 내부통제가 강화되는 시점에 공공기관의 LH사태 등 내부통제가 적절하게 이루어지지 않고 있다는 지적이 이어지고 있다. 이에 본 연구는 공공기관의 내부통제 운영현황과 운영평가 결과를 비교·분석함으로써 공공부문에서의 내부통제 견제 실효성에 대한 논의를 하고자 한다. 구체적으로 본 연구는 공공기관의 자체감사활동, 윤리경영, 내부통제 등의 평가결과를 비교분석하고, 공공부문의 내부통제시스템 효율적 운영과 그 실효성 방안을 살펴보기 위해 관련 선행연구를 검토하고자 한다. 또한 본 연구는 내부품질 관련 평가 현황과 추세를 분석하여 공공기관의 내부통제 효과성 개선을 위한 방향성을 제시한다. 이를 통해 민간기업과는 다른 공공기관의 특징적인 내부통제시스템을 분석하고 향후 공공기관의 내부통제시스템의 운영방향성을 제시한다는 관점에서 선행연구에 추가적인 의미가 있을 것이다.