본 연구에서는 한국의 남해안 연안 해역 퇴적물에서 10개 과불화화합물(Perfluorinated Compounds, PFCs)의 검출 특성과 해수에서 연도별 PFCs의 농도를 조사하였다. 채취된 시료에 대한 기기분석법은 liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC/ESI-MS/MS) 법을 사용하여 분석하였다. PFOA (erfluorooctanonic acid) PFOS (perfluorooctane sulfonate), PFNA (perfluorononanoic acid), PFDA (perfluorodecanoic acid), PFUnDA (perfluoroundecanoic acid), PFDoDA (perfluorododecanoic acid) 의 6 종류 PFCs 가 남해안 연안 해역 퇴적물에서 검출되었다. 총 PFCs 값은 모든 지점에서검출되었으며, 검출 농도는 0.085-0.705 ng/g.dw (dry weight)의 범위로 나타났다. 2015년 남해안 해역 퇴적물에서 출현빈도 및 농도가 높은 PFCs 는 PFOA와 PFOS 이었으며, 평균 농도 범위는 각각 0.065-0.175 ng/g.dw (dry weight) 와N.D.-0.34 ng/g.dw (dry weight) 였다. 그러나 남해안 해역 해수에서는 PFOA, PFNA, PFHxS (perfluorohexane sulfonate), PFOS의 4종류 PFCs 가 검출되었다. 3년 동안 남해안 해역 해수에서 출현 빈도 및 농도가 높은 PFCs는 PFOA와 PFOS 이었으며, 연도별 평균 농도 범위는 각각 7.27-25.52 ng/L와 N.D.-33.51 ng/L으로 나타났다. 이러한 결과는 한국 남해안연안 해역 퇴적물 및 해수에서 PFOA와 PFOS의 화합물에 대한 지속적인 모니터링의 필요성을 시사한다.