본 연구에서는 한국의 남쪽 수계에서 Perfluorinated Compounds(PFCs)의 모니터링을 위해 섬진강 수계 및 남해안 연안에서 10개의 PFCs 화합물에 대한 분포 특성을 조사하였다. 채취된 시료의 전처리는 HLB(hydrophilic-lipophilic balanced) 충진물이 채워진 카트리지(cartridge)를 이용한 고상추출법(solid-phase extraction, SPE)을 사용하였고, 기기분석법은 LC/ESI- MS/MS 법을 사용하여 분석하였다. 사용된 분석기의 PFCs 방법검출한계(method detection limit, MDL)는 0.4-1.9 ng/L, 정량한계(limits of qantification, LOQ)는 1.5-6.1 ng/L이었다. 10개의 PFCs 중에서 섬진강 수계에서 검출 빈도 및 농도가 높은 화합물은 perfluorooctane sulfonate(PFOS), perfluorooctanoic acid(PFOA)와 perfluorononanoic acid(PFNA)로 나타났으며, 섬진강 수계에서 FPOS는 < LOQ-19.60 ng/L, PFOA는 < LOQ-20.59 ng/L, PFNA는 < LOQ-34.62 ng/L 농도 분포를 보였다. 남해안 연안 해역에서는 PFOS와 PFOA가 검출빈도 및 농도가 높았고, FPOS는 < LOQ-48.00 ng/L, PFOA는 < LOQ-24.13 ng/L 농도 분포를 보였다. PFHxS의 농도는 PFOS와 PFOA 농도보다 낮았으며, 그 밖의 PFCs는 검출되지 않았다. 이러한 결과는 지역 수계에서 PFCs의 농도 분포특성에 대한 지속적인 조사의 필요성을 시사한다.