영상 분할은 의료 영상 처리에서 중요한 역할을 수행하지만 영상 분할 알고리즘의 많은 연산량은 실생활에서의 사용을 제약하는 요인이 된다. 따라서 본 논문에서는 본 논문에서는 고해상도 의료 영상 분할 알고리즘의 실시간 처리를 위해 GPGPU(general purpose graphics processing unit)상에서 영상 분할 알고리즘인 Fuzzy C-Means(FCM)의 병렬구현 방법을 제안한다. 본 논문에서는 GPU상에서 FCM 알고리즘의 고속화를 위해 대상 영상을 재구성하고, 단일 쉐이더 코어에서 필요한 레지스터 개수를 바탕으로 FCM 알고리즘을 위한 최적의 쓰레드(thread)와 블록(block)의 크기를 계산한다. 성능 평가를 위해 본 논문에서는 총 5가지 크기의 의료 영상(64×64, 128×128, 256×256, 512×512, 1,024×1,024)을 이용하여 단일 CPU대비 향상된 실행 시간을 측정하였고, 모의실험 결과 64x64 영상을 제외한 나머지 영상에서 단일 CPU 보다 약 4배 높은 실행 시간의 향상을 나타내었다.