이 논문의 목적은 사상의학은 한의학과 다른 철학적 근거 위에 성립된 새로운 의학 이론이라는 가정 하에 이를 검증하고, 그 근거가 무엇인지를 밝히는 데 있다. 이를 위해 필자는 한의학 이론 계승의 문제와 사상의학 이론의 전개 구조를 검토한 다음 성명, 리기, 성정 개념을 중심으로 사상설의 철학적 근거를 검토했다. 한의학은 인간을 오행이론의 초월적인 방식으로 해명했지만 사상의학 이론은 인간을 유기체적 존재로 이해하면서도 경험에 근거한 실증적 방식으로 해명했다. 이제마는 인간을 사상구조 안에 존재하는 경험적 존재로 파악하고, 이를 인간 중심의 해명을 통해 검증하려고 했다. 그리고 이러한 해명을 위해 유학에 근거하되 경험의 관점에서 재구성한 철학적 근거를 토대로 이론화한 다음 이를 확충시켜 장부 이론의 토대를 마련했다. 이러한 사상설의 철학적 근거는 한의학과 유학에 대해서는 인간 해명 방식에 대한 물음을, 그리고 이론의 연구와 진료 방법에 있어서는 사변적 방식에서 검증 가능한 경험적 방식으로서의 전환을 촉구한 것이다. 이러한 의미에서 이제마 사상설의 철학적 근거는 인간 존재에 대한 새로운 해명이며, 그것은 사상의학 이론에 대한 연구 방향은 물론 우리 사회에 존재하는 다양한 질병 치유 방법과도 소통할 수 있는 방식을 제공한 것으로 평가할 수 있을 것이다.