본 논문은 수소연료전지 열관리 시스템의 냉각을 위한 30 kW 팬 모터의 형상을 최적화하고 영구자석 사용량을 줄이는 방안을 연구한다. 수소연료전지를 사용하는 상용차는 온실가스 배출 감축을 위해 주목을 받고 있지만, 연료전지 운전 중에 발생하는 고 열은 시스템 성능과 수명에 부정적인 영향을 미치므로 열 관리가 중요하다. 본 연구는 기존 팬 모터를 기반으로 희토류 영구자석의 사용량을 줄이면서도 동일한 성능을 유지하고자 하였다. 영구자석 두께, 자석 가이드, 공극 등 주요 설계 변수를 최적화하여 자석 두께를 절반으로 줄였으며, 이 과정에서 코깅 토크 증가 및 효율 저하와 같은 문제점을 해석하였다. 그 결과, 축소된 모델은 자석 크기를 기존 모델 대비 51% 줄였음에도 동일한 출력을 유지하였으며, 전류 및 전류 밀도 증가, 효율 저하 등의 문제점이 일부 발생하였다. 또한, 온도 및 불가역 감자 해석을 통해 고온 환경에서의 안정성을 확인했다.